Устанавливать по-верх версии ниже патча. Имя патча в архиве: cs16patch_full_v35(4156).exe
После установки появляется меню Steam. Это незначит что патч для Steam версии. Патч NonSteam. Для запуска Counter-Strike пользуйтесь ярлыком созданным на рабочем столе после установки, или добавьте к своему ярлыку директиву -steam .